MESH term 관련된 공부를 좀 더 해야할 것 같음
MESH tree의 숫자를 포함해서.. 질병을 간소화?시키는 질문을 해야하지 않을까 하는 생각이 듦.
context information은 나중에 어떻게 비교할건지..??에 대한 의문이 듦 (gene card와 비교??)
gene card와 비교할 방법을... 잘 찾아야할거같다..
🖇 CSV file return
Chat GPT 에게 질문
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context를 너무 자세히 대답해 준게 문제인 것 같아 반영
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답변
MT-ND2의 경우, 저번에는 down-regulated라고 나왔는데 이번에는 up-regulated로 나옴
MT-ND2의 reference를 제외한 모든 reference가 전혀 상관 없는 내용, MT-CO2의 reference는 페이지를 찾을 수 없음 -
regulation이랑 references가 틀린 것 같다고 다시 얘기해줬음
Are you sure about that table??? The regulations and references seem incorrect;;;
MT-CO1, MT-CO2 references : Page Not Found
Else : same reference
- MT-ND2의 reference를 읽어봐도 up, down에 관한 구체적 얘기가 없음
- 지난 번 reference를 언급하며, down-regulated인 것 같다고 말함
원하던 context가 나옴!!
이걸 처음부터 주지 않았던 이유는 뭘까..?
어떻게 하면 말하지 않아도 관련된 context와 함께 regulation의 방향을 제시해 줄지 고민해봐야 할듯..
Up or Down Regulation in PDAC_6 genes
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다른 gene에도 비슷한 context가 있는지 찾아보고 표로 제시해달라고 질문함
MT-ND2의 down-regulated의 reference를 제외하고 전부 page not found
참고로 이 reference는 내가 준 것임..
🤬 url이 안눌린다고 했지만 변하는게 없었음,, 그리고 copy하게 full url 달라고 해서 들어가보니 Page not Found
🤬 Page Not found라고 말하며 다른 reference 찾아달라고 해도 같은 reference만 7번 줌 -
참다참다 화를 냈더니 다른 url을 찾아줬다
근데 이중에 4개의 Page가 unavailable, 1개는 다른 내용의 paper
나머지 하나는 그냥 genecard url을 갖다줌... -
페이지 안열리고 표로 만들라고 함
걍 이제 전부 genecard로 준다 ...
🖇 다른 gene list dataset
- 나머지 gene들에 대해서도 표를 달라고 100개 gene file을 보내줌
- 결국 gene 파일을 복붙해서 알려줬더니 csv 파일 만드는 방법에 대해 알려줌..
- 20개로 줄였더니
- 전부 unknown으로 뽑아버린다
🌟 6개씩 출력해주는게 한계라고 판단
🖇 6개씩 data 출력
- 6개씩 직접 나눠서 질문 후 입력하는 방식으로 진행
Okay, then now please provide the regulation and context for these genes (MT-CO3, MT-ND3, MT-ND4L, MT-ND4, MT-ND5, MT-ND6) in the table
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pubmed ID 혹은 DOI로 reference를 달라고 한 결과
그 무엇도 맞지 않았음.. 존재하지 않기도, paper 가 아닌 경우도 존재
보통 다른 주제의 paper을 줌
갑자기 MT-ND2의 down-regulated되는 튜플을 출력하지 않음 -
이런 방향으로 진행하기 어렵다고 판단...
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재 회의 진행 !!
