margin과 padding을 쓰는 기준?

없다. 정답은. 그러나 자신 나름대로의 기준이 있는 것이 좋겠다.

만약 초기 레이아웃 구성하는데 nav와 header는 padding으로 레이아웃은 구분해놓고

footer부분은 margin으로 구분한다면 코드관리에 불편하지 않겠는가?