BCSS Dataset - Label and Resolution

boingboing·2024년 2월 5일

Resolution

  • MPP : Microns per pixel
  • MPP 0.25는 "표준화된" 40x Aperio Scanner임

Segmentation

  • Segmentation 하나 에 있는 정보

Super group -> 따로 없는 것 같음. ground truth에도 그런 말 없었음. json파일 봐도..group만 있는 듯.

각 segmentation마다 group, label, points, id가 있음.
coco의 categories = 여기서의 group임.

Ground-Truth Code

  • 레이블(클래스)은 151장의 WSI에 다 동일하게 적용되는 듯.

label GT_code
outside_roi 0
tumor 1
stroma 2
lymphocytic_infiltrate 3 (림프구성 침윤성 병변?)
necrosis_or_debris 4 (괴사 or 잔해)
glandular_secretions 5 (선 분비물??)
blood 6
exclude 7
metaplasia_NOS 8 (화생)
fat 9 (지방)
plasma_cells 10 (혈장 세포)
other_immune_infiltrate 11 (다른 면역 침투(?))
mucoid_material 12 (점액)
normal_acinus_or_duct 13 (소포 or 관)
lymphatics 14 (림프관)
undetermined 15 (정의되지 않은)
nerve 16 (신경)
skin_adnexa 17 (피부 부속기)
blood_vessel 18 (혈관)
angioinvasion 19 (혈관 침범)
dcis 20 (항 파킨슨제 ?? 머야)
other 21

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