Cmap과 Kmap EF (Matched Cell)

박신영·2024년 8월 23일
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SPL internship_2024

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EF(Enrichment Factor)

  • 정의 : EF는 실제로 발견된 활성 활성 화합물의 비율을 랜덤 선택으로 기대되는 활성 화합물의 비율과 비교한 값
  • 공식 :
  • 결론 : 스크리닝 실험에서 특정 특성의 농축 정도를 나타내며, 기대값에 비해 실제로 발견된 비율을 측정

Sample id 매칭 후 EF 출력


up, down에 대해 각 행마다 EF를 계산하여 나타냄

EF 값을 시각화


로그 취하여 시각화

dose 별로 나타냄


랜덤인거 박스플랏

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