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Cmap과 Kmap EF (Matched Cell)
박신영
·
2024년 8월 23일
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SPL internship_2024
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EF(Enrichment Factor)
정의
: EF는 실제로 발견된 활성 활성 화합물의 비율을 랜덤 선택으로 기대되는 활성 화합물의 비율과 비교한 값
공식
:
결론
: 스크리닝 실험에서 특정 특성의 농축 정도를 나타내며, 기대값에 비해 실제로 발견된 비율을 측정
Sample id 매칭 후 EF 출력
up, down에 대해 각 행마다 EF를 계산하여 나타냄
EF 값을 시각화
로그 취하여 시각화
dose 별로 나타냄
랜덤인거 박스플랏
박신영
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