[Hadoop] Weather Dataset 병렬 처리 비교 - Unix Tool vs. Hadoop

hwwwa·2023년 3월 25일
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🐘 BigData Programming

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Weather Dataset

  • National Climatic Data Center
    • http://www.ncdc.noaa.gov/
    • 기상 센서들이 수집하는 대량의 로그데이터 → semi-structured, record-oriented
    • 한 행이 하나의 레코드, 행 단위의 아스키코드 형식
    • 기상관측소별로 측정된 정보는 gzip으로 압축되어 연도별 디렉토리에 위치함
    • 수만 개의 기상관측소가 존재하기 때문에 전체 데이터셋은 상대적으로 작은 파일이 매우 많음
    • 하둡의 특성상 소수의 큰 파일이 처리하기 쉽고 효율적
      → 다수의 파일을 연도를 기준으로 하나의 파일로 병합하기 위해 먼저 전처리 작업 수행 필요
  • Dataset의 형식은 아래와 같음
0057
332130   # USAF weather station identifier
99999    # WBAN weather station identifier
19500101 # observation date
0300     # observation time
4
+51317   # latitude (degrees x 1000)
+028783  # longitude (degrees x 1000)
FM-12
+0171    # elevation (meters)
99999
V020
320      # wind direction (degrees)
1        # quality code
N
0072
1
00450    # sky ceiling height (meters)
1        # quality code
C
N
010000   # visibility distance (meters)
1        # quality code
N
9
-0128    # air temperature (degrees Celsius x 10)
1        # quality code
-0139    # dew point temperature (degrees Celsius x 10)
1        # quality code
10268    # atmospheric pressure (hectopascals x 10)
1        # quality code

Analyzing the Data with Unix Tool

유닉스 도구 awk를 사용한 행 기반 데이터 처리

# NCDC weather dataset에서 연도별 최고 기온을 찾는 프로그램
#!/usr/bin/env bash
for year in all/* do
echo -ne `basename $year .gz`"\t" gunzip -c $year | \
    awk '{ temp = substr($0, 88, 5) + 0;
           q = substr($0, 93, 1);
           if (temp !=9999 && q ~ /[01459]/ && temp > max) max = temp }
         END { print max }'
done
  • 반복문으로 압축된 연도별 파일을 돌며 해당 연도를 출력한 후 awk를 이용해 각 파일을 처리
  • awk 스크립트는 데이터에서 기온과 특성의 두 필드를 추출
    • 기온에 0을 더하면 정수형으로 변환됨
  • 기온이 유효한 값을 가지는지(9999는 누락된 값), 특성 코드가 측정 값을 신뢰할 수 있다고 보는지 점검 → 문제가 없다면 현재 최고 기온과 비교하여 갱신
  • END 영역은 파일에 있는 모든 행이 처리된 후에 실행됨. 최종 최고 기온 출력

출력 결과

# 출력결과
% ./max_temperature.sh
1901 317
1902 244
1903 289
1904 256
1905 283...
  • EC2 High-CPU Extra Large Node 하나에서 한 century(100년)에 대해 전체 실행 시간은 42분 소요
  • Operating in a parallel way? problems..
  • 처리 속도 향상을 위해 parallel로 수행할 필요가 있음
  • 이론적으로는 한 대의 머신에 있는 모든 하드웨어 thread를 활용해 연도별 파일을 서로 다른 프로세스에 할당하면 되지만, 문제점이 있음
    1. 작업을 정확히 같은 사이즈로 나누는 것은 매우 어려움
    2. diff의 결과 합병을 위해 프로세스에서 추가 처리 필요
    3. a single machine의 processing capacity(처리 능력)가 제한적
  • 병렬 처리가 쉬워보이지만 실제로는 매우 복잡하기 때문에 하둡과 같은 프레임워크를 사용하는 것이 좋음

Analyzing the Data with Hadoop

  • MapReducemap 단계와 reduce 단계의 두 단계로 나누어 처리
    • 각 단계는 입력과 출력으로 key-value 쌍을 가지며, type은 프로그래머가 선택 가능
    • 프로그래머가 map 함수와 reduce 함수를 작성
  • NCDC 원본 데이터
0067011990999991950051507004...9999999N9+00001+99999999999...
0043011990999991950051512004...9999999N9+00221+99999999999...
0043011990999991950051518004...9999999N9-00111+99999999999...
0043012650999991949032412004...0500001N9+01111+99999999999...
0043012650999991949032418004...0500001N9+00781+99999999999...

Input to the map function

  • 각 행의 타입을 텍스트로 인식하는 텍스트 입력 포맷 선택
  • 값은 각 행(문자열)이고, 키는 파일의 시작부에서 각 행이 시작되는 지점까지의 오프셋
    • 해당 데이터에서는 키가 의미가 없으므로 무시해도 됨
  • 위와 같은 원본 데이터가 아래와 같이 key, value의 쌍으로 변환되고 map 함수의 입력이 됨
(0, 006701199099999**1950**051507004...9999999N9+**0000**1+99999999999...)
(106, 004301199099999**1950**051512004...9999999N9+**0022**1+99999999999...)
(212, 004301199099999**1950**051518004...9999999N9-**0011**1+99999999999...)
(318, 004301265099999**1949**032412004...0500001N9+**0111**1+99999999999...)
(424, 004301265099999**1949**032418004...0500001N9+**0078**1+99999999999...)

Output from the map function

  • map 함수는 연도와 기온(위에서 bold 처리된 숫자)을 추출하여 output으로 내보냄
    • 기온은 정수형으로 변환됨
(1950, 0)
(1950, 22)
(1950, -11)
(1949, 111)
(1949, 78)

Input to the reduce function

  • map의 output이 reduce의 input으로 보내지는 과정은 맵리듀스 프레임워크에 의해 처리됨
  • key(연도)-value(기온) pair는 key를 기준으로 정렬되고 그룹화됨
(1949, [111, 78])
(1950, [0, 22, -11])

Output from the reduce function

  • 연도별로 측정된 모든 기온값이 하나의 리스트로 묶임. reduce 함수는 리스트 전체를 반복하여 최고 측정값을 추출
(1949, 111)
(1950, 22)

2022-2 KHU 빅데이터프로그래밍 수업을 기반으로 작성하였습니다.

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