BioPython🧬💻

한주현 생물정보학자가 출간한 바이오파이썬으로 만나는 생물정보학: 파이썬 프로그래밍을 통해 풀어보는 생명의 구조 책과 함께 바이오파이썬에 대한 공부를 시작한다.새로이 알게 된 사실이나 중요하게 생각하는 부분을 이곳에 정리하여 올리고자 한다.아자자 화이팅이닷...

첫째, 파싱작업파싱: 데이터에서 원하는 정보를 가져오는 것, 바이오파이썬에서는 FASTA,FASTQ, GenBank 등의 정보로부터 필요한 부분을 가져오는 작업둘째, 유전체 서열정보를 문자열 수준에서 다룰 수 있다유전체 데이터를 파싱하여 가져와 서열데이터를 문자열처럼

FASTA 포맷: 텍스트 기반 포맷. 염기서열 또는 단백질서열을 나타내기 위해 만든 파일 포맷.FASTA 파일은 > 기호로 시작. FASTQ 포맷: 텍스트 기반 포맷. 염기서열과 염기서열에 해당하는 퀄리티 점수를 포함한 파일 포맷총 네 줄로 구성. 4줄 -> 하나의 리

tata box란? 유전적 시퀀스가 읽혀지고 디코드 되는 곳을 나타내는 DNA sequence.promoter sequence의 타입으로 전사(transcription)이 시작되는 다른 분자를 지정함.(출처: https://www.nature.com/scita