profile
Goal: drug design with AI
post-thumbnail

AlphaGenome 메모

non-coding DNA 변이가 유전자 조절에 미치는 영향을 예측하기입력 sequence의 길이가 길면 해상도가 떨어지고, 해상도를 높이면 입력 범위가 제한되었다.특정 task(ex. 발현량, splicing)만 예측할 수 있는 모델이 대부분이었다 (generaliz

2025년 7월 1일
·
0개의 댓글
·

클러스터 컴퓨팅 환경에서 Python Debugger 사용하기

ssh -L 5454:localhost:5454 USERNAME@gnode000{ "version": "0.2.0", "configurations": \[ { "name": "Attach to Remote Debug", "type": "pyt

2025년 4월 17일
·
0개의 댓글
·

bash에선 docker 권한이 있는데, tmux에서는 docker 권한이 없을 때

bash에서 groups 명령해서 docker가 뜨고, tmux에서 groups 입력했을 때 docker가 안 뜰 경우 -> group에 추가해줄 수 있다.

2025년 2월 14일
·
0개의 댓글
·
post-thumbnail

VSCode 디버깅, Conda 환경의 라이브러리 불러오기가 안 될 때

debug 모드를 켜고 Add Configuration을 선택한다. \-Python File 선택하면 /home/user/.vscode/ 경로에 launch.json파일이 자동 생성된다. 위와 같은 형식으로 입력해주고 저장 후 F5를 누르면 conda 환경에 저장된 라

2025년 2월 6일
·
0개의 댓글
·
post-thumbnail

ChimeraX 구조 시각화 + 비교하기

pdb 또는 cif 파일을 ChimeraX 작업창에 드래그 해준다. Files > Open 해서 pdb 또는 cif 파일을 찾아도 된다. 가독성 있게 단백질 구조를 보기 위해 필자가 사용하는 방법일 뿐 색은 자유롭게 바꾸어도 상관없다. 전체 색은 회색으로 맞춘다. co

2024년 11월 25일
·
0개의 댓글
·

Git → Github in terminal

git 명령어로 local repository와 github repository 연동하기

2024년 11월 8일
·
0개의 댓글
·